La creación de este grupo de trabajo se ratificó durante la última reunión del Comité de Seguimiento del POCTEFA de junio de 2012. Este Comité de Pilotaje, surgido del Comité de Seguimiento, está compuesto por representantes del estado francés, español y andorrano, de los diferentes territorios implicados en el programa, así como por representantes de las autoridades medioambientales.
Tiene como objetivo dirigir los trabajos colectivos de preparación del futuro programa que tendrán como consecuencia la redacción del Programa Operativo para el periodo 2014-2020 según las etapas y las obligaciones establecidas. Este programa operativo es el documento en el que se describe toda la estrategia de intervención del FEDER y su implantación para la cooperación territorial en la frontera España-Francia-Andorra para el periodo 2014-2020. Se trata de una obra consecuente con una descripción del contexto territorial, socioeconómico, una exposición de las estrategias de intervención, de las prioridades para el programa, del plan de financiación, de los ejes de cooperación…